Benicio del Toro s-a născut pe 19 fenruarie 1967 în Santuce, Puerto Rico. Ambii săi părinți erau avocați. Pe când Benicio avea 9 ani, mama lui a murit de hepatită, iar familia lui s-a mutat în Mercersburg, SUA. După liceu, Benicio s-a apucat de studii economice la Universitatea de Stat din San Diego, dar a renunțat fiind încurajat de prieteni să se apuce de actorie.
Cariera lui a luat o turnură ascendentă abia în 1995 în urma rolului din Suspecți de serviciu. Succesul lui în rolul respectiv a fost atât de mare încât Del Toro a fost ales imediat mai multe roluri importante în The Funeral, Basquiat și The Fan pentru care a primit aprecieri maxime atât din partea publicului, cât și a criticilor.